Отделение находится на 5 этаже Центра и располагает 6 одноместными палатами повышенной комфортности и 8 палатами, рассчитанными на 4-6 пациентов.
Ежегодно в отделении выполняется около 1000 хирургических вмешательств. Из них около 800 операций по поводу геморроя, анальных трещин, свищей прямой кишки, пресакральных кист и хронического воспаления эпителиального копчикового хода.
На базе отдела общей колопроктологии за время его существования защищено 43 кандидатских диссертаций и 3 докторские диссертации. Выпущено 7 монографий.